Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC1P02654 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC1P02654 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms