Protein–RNA interactions for Protein: O95758

PTBP3, Polypyrimidine tract-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP3O95758 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTBP3O95758 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms