Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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KDM4BO94953 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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KDM4BO94953 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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KDM4BO94953 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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KDM4BO94953 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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