Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRMUO75648 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRMUO75648 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRMUO75648 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRMUO75648 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms