Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO3O43524 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO3O43524 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms