Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APAF1O14727 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APAF1O14727 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APAF1O14727 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APAF1O14727 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APAF1O14727 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APAF1O14727 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APAF1O14727 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APAF1O14727 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APAF1O14727 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms