Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms