Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRPO00591 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRPO00591 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms