Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3C2AO00443 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3C2AO00443 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms