Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms