Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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