Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf172C9J069 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms