Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms