Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms