Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms