Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A4Q9Y6R1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms