Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLF12Q9Y4X4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms