Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2Q9Y4W6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
AFG3L2Q9Y4W6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms