Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNSTRNQ9Y448 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms