Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SORCS3Q9UPU3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SORCS3Q9UPU3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms