Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
USP18Q9UMW8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms