Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZMYND8Q9ULU4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms