Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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