Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUF60Q9UHX1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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