Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHORDC1Q9UHD1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms