Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms