Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKX1-2Q9UD57 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms