Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGAT4CQ9UBM8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms