Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms