Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms