Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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