Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HACD3Q9P035 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms