Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms