Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms