Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BSDC1Q9NW68 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSDC1Q9NW68 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms