Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4BQ9NT99 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC4BQ9NT99 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms