Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms