Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms