Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASS4Q9NQ75 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms