Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms