Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FZD3Q9NPG1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms