Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms