Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms