Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms