Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms