Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF4Q9BUZ4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms