Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA3Q9BQP9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA3Q9BQP9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA3Q9BQP9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA3Q9BQP9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA3Q9BQP9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA3Q9BQP9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA3Q9BQP9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA3Q9BQP9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA3Q9BQP9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA3Q9BQP9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BPIFA3Q9BQP9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms