Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms