Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RETNLBQ9BQ08 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms