Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRG3Q99928 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms